Som på de andre cykladiske öer blev civilisationen udviklet så tidligt som 3000 f. Kr.

Öen nåede sin storhedstid under Lygdamis, som styrede 6000 f. Kr. Det var da det arkaiske tempel til äre for Apollo blev påbegyndt, lignende templer blev bygget samtidigt i Athen og på Samos.

Naxos by (Chora) er en hyggelig og meget typisk gräsk by. Havnegaden er den store gade og fra den sträkker der sig mange mindre gader.

Der findes mange fine landsbyer på öen, som alle har sin egen historie at fortälle. Landsbyer sojm ligger mellem höje bjerge, mellem oliven-og citronlunde, langs med fantastiske strande o.s.v. Der findes også mange historiske steder at besöge, så som museer, arkeologiske steder, monument, borge, kirker m.m.